Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTCH1Q13635 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTCH1Q13635 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTCH1Q13635 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTCH1Q13635 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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