Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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