Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCOF1Q13428 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCOF1Q13428 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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