Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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