Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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