Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TRAF2Q12933 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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