Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TWF1Q12792 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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