Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms