Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms