Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms