Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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