Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HBBP68871 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HBBP68871 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms