Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms