Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms