Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NDST1P52848 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDST1P52848 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST1P52848 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST1P52848 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST1P52848 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST1P52848 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST1P52848 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDST1P52848 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms