Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF143P52747 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms