Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATMP50440 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATMP50440 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATMP50440 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATMP50440 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATMP50440 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATMP50440 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATMP50440 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATMP50440 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms