Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK1EP49674 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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