Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms