Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCAMP43121 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCAMP43121 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms