Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms