Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SOX11P35716 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SOX11P35716 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SOX11P35716 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SOX11P35716 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SOX11P35716 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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