Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARID4AP29374 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms