Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms