Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DESP17661 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms