Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOT1P17174 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOT1P17174 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms