Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms