Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF2RAP15509 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms