Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SLC25A20O43772 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms