Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms