Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms