Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.3 ms