Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms