Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms