Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVW-1Q9UQF0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms