Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms