Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms