Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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