Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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