Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms