Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms