Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms