Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms