Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms