Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD13CQ8N6S4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms