Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms