Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RASSF3Q86WH2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms