Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RFPL4BQ6ZWI9 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms