Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms