Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms